Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFRP42898 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFRP42898 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFRP42898 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms