Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC19A1P41440 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC19A1P41440 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms