Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARSP41250 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARSP41250 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARSP41250 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARSP41250 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARSP41250 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARSP41250 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GARSP41250 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GARSP41250 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GARSP41250 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARSP41250 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARSP41250 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARSP41250 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARSP41250 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARSP41250 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARSP41250 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GARSP41250 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GARSP41250 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARSP41250 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GARSP41250 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GARSP41250 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARSP41250 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARSP41250 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARSP41250 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARSP41250 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARSP41250 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GARSP41250 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARSP41250 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GARSP41250 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GARSP41250 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GARSP41250 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GARSP41250 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARSP41250 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARSP41250 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GARSP41250 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GARSP41250 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARSP41250 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARSP41250 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GARSP41250 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARSP41250 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARSP41250 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARSP41250 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARSP41250 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARSP41250 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GARSP41250 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GARSP41250 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GARSP41250 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GARSP41250 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GARSP41250 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms