Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SERPINF1P36955 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms