Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHI3L1P36222 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms