Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP6P35125 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP6P35125 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP6P35125 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP6P35125 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP6P35125 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP6P35125 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP6P35125 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP6P35125 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP6P35125 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP6P35125 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP6P35125 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP6P35125 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP6P35125 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP6P35125 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP6P35125 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP6P35125 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP6P35125 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP6P35125 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP6P35125 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP6P35125 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP6P35125 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP6P35125 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP6P35125 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP6P35125 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
USP6P35125 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP6P35125 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP6P35125 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP6P35125 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP6P35125 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP6P35125 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
USP6P35125 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
USP6P35125 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP6P35125 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP6P35125 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP6P35125 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
USP6P35125 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP6P35125 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
USP6P35125 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP6P35125 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP6P35125 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP6P35125 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP6P35125 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP6P35125 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP6P35125 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP6P35125 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP6P35125 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
USP6P35125 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP6P35125 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
USP6P35125 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP6P35125 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP6P35125 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP6P35125 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP6P35125 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP6P35125 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP6P35125 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP6P35125 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP6P35125 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP6P35125 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP6P35125 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP6P35125 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP6P35125 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
USP6P35125 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
USP6P35125 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms