Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A4P31645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A4P31645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms