Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GTF2E1P29083 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF2E1P29083 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms