Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCAP28676 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCAP28676 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCAP28676 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCAP28676 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCAP28676 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCAP28676 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCAP28676 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCAP28676 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCAP28676 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCAP28676 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCAP28676 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCAP28676 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCAP28676 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCAP28676 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCAP28676 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCAP28676 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCAP28676 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCAP28676 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCAP28676 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCAP28676 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCAP28676 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCAP28676 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms