Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX3P23760 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX3P23760 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAX3P23760 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAX3P23760 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAX3P23760 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAX3P23760 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAX3P23760 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX3P23760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX3P23760 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAX3P23760 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAX3P23760 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAX3P23760 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX3P23760 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX3P23760 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX3P23760 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAX3P23760 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAX3P23760 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAX3P23760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAX3P23760 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX3P23760 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX3P23760 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX3P23760 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX3P23760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAX3P23760 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX3P23760 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX3P23760 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX3P23760 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX3P23760 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX3P23760 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX3P23760 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX3P23760 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX3P23760 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAX3P23760 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX3P23760 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAX3P23760 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAX3P23760 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAX3P23760 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAX3P23760 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX3P23760 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX3P23760 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX3P23760 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms