Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CA4P22748 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CA4P22748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CA4P22748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA4P22748 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CA4P22748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA4P22748 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CA4P22748 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CA4P22748 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CA4P22748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CA4P22748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CA4P22748 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CA4P22748 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CA4P22748 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CA4P22748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CA4P22748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CA4P22748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CA4P22748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CA4P22748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CA4P22748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CA4P22748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CA4P22748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CA4P22748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CA4P22748 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CA4P22748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CA4P22748 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CA4P22748 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CA4P22748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CA4P22748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CA4P22748 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CA4P22748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CA4P22748 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CA4P22748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CA4P22748 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CA4P22748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms