Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCP1P17987 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCP1P17987 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCP1P17987 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCP1P17987 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCP1P17987 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCP1P17987 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCP1P17987 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCP1P17987 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCP1P17987 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCP1P17987 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCP1P17987 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCP1P17987 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCP1P17987 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCP1P17987 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCP1P17987 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCP1P17987 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCP1P17987 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCP1P17987 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCP1P17987 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCP1P17987 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCP1P17987 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCP1P17987 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCP1P17987 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCP1P17987 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCP1P17987 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCP1P17987 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCP1P17987 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCP1P17987 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCP1P17987 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCP1P17987 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCP1P17987 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCP1P17987 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCP1P17987 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCP1P17987 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCP1P17987 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCP1P17987 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCP1P17987 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCP1P17987 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCP1P17987 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TCP1P17987 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCP1P17987 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCP1P17987 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCP1P17987 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCP1P17987 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms