Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPEP16870 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPEP16870 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPEP16870 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPEP16870 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPEP16870 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPEP16870 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPEP16870 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPEP16870 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPEP16870 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPEP16870 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPEP16870 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPEP16870 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPEP16870 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPEP16870 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CPEP16870 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPEP16870 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPEP16870 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CPEP16870 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPEP16870 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPEP16870 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPEP16870 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CPEP16870 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms