Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF3P15923 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF3P15923 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF3P15923 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF3P15923 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF3P15923 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF3P15923 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF3P15923 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF3P15923 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF3P15923 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCF3P15923 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF3P15923 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF3P15923 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF3P15923 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF3P15923 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF3P15923 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF3P15923 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF3P15923 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF3P15923 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF3P15923 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF3P15923 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF3P15923 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF3P15923 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF3P15923 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF3P15923 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF3P15923 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF3P15923 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF3P15923 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF3P15923 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF3P15923 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF3P15923 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF3P15923 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF3P15923 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF3P15923 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF3P15923 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF3P15923 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF3P15923 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF3P15923 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF3P15923 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF3P15923 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF3P15923 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF3P15923 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF3P15923 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF3P15923 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF3P15923 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF3P15923 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCF3P15923 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCF3P15923 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms