Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VEGFAP15692 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFAP15692 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms