Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FDPSP14324 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FDPSP14324 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FDPSP14324 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FDPSP14324 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FDPSP14324 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FDPSP14324 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FDPSP14324 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FDPSP14324 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FDPSP14324 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FDPSP14324 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FDPSP14324 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FDPSP14324 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FDPSP14324 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FDPSP14324 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FDPSP14324 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDPSP14324 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDPSP14324 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FDPSP14324 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FDPSP14324 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FDPSP14324 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FDPSP14324 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FDPSP14324 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FDPSP14324 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FDPSP14324 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FDPSP14324 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDPSP14324 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDPSP14324 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FDPSP14324 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FDPSP14324 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDPSP14324 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDPSP14324 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDPSP14324 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDPSP14324 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDPSP14324 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDPSP14324 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FDPSP14324 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FDPSP14324 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FDPSP14324 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FDPSP14324 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FDPSP14324 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FDPSP14324 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FDPSP14324 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FDPSP14324 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.3 ms