Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-EP13747 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms