Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARGP13631 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARGP13631 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARGP13631 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARGP13631 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARGP13631 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARGP13631 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RARGP13631 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARGP13631 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARGP13631 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARGP13631 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARGP13631 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARGP13631 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARGP13631 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARGP13631 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARGP13631 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARGP13631 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RARGP13631 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARGP13631 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARGP13631 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARGP13631 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARGP13631 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARGP13631 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARGP13631 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARGP13631 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARGP13631 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARGP13631 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARGP13631 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARGP13631 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARGP13631 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARGP13631 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARGP13631 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARGP13631 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARGP13631 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARGP13631 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARGP13631 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARGP13631 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARGP13631 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARGP13631 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARGP13631 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARGP13631 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARGP13631 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARGP13631 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARGP13631 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms