Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM1P13164 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms