Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRBP10828 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRBP10828 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRBP10828 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRBP10828 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRBP10828 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRBP10828 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRBP10828 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRBP10828 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRBP10828 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRBP10828 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRBP10828 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRBP10828 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRBP10828 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRBP10828 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRBP10828 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRBP10828 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRBP10828 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRBP10828 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms