Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IGKV1-13P0DP09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IGKV1-13P0DP09 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms