Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC159P0C7I6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC159P0C7I6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms