Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP1P09874 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP1P09874 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP1P09874 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP1P09874 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP1P09874 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP1P09874 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP1P09874 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP1P09874 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP1P09874 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP1P09874 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP1P09874 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP1P09874 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP1P09874 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP1P09874 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP1P09874 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP1P09874 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP1P09874 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP1P09874 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP1P09874 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP1P09874 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP1P09874 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP1P09874 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP1P09874 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP1P09874 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP1P09874 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP1P09874 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP1P09874 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP1P09874 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP1P09874 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP1P09874 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP1P09874 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP1P09874 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP1P09874 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP1P09874 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP1P09874 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP1P09874 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP1P09874 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP1P09874 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP1P09874 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP1P09874 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP1P09874 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP1P09874 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP1P09874 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP1P09874 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP1P09874 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP1P09874 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP1P09874 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP1P09874 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP1P09874 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP1P09874 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP1P09874 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP1P09874 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP1P09874 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP1P09874 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP1P09874 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP1P09874 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms