Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms