Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT16P08779 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT16P08779 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT16P08779 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT16P08779 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT16P08779 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT16P08779 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT16P08779 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT16P08779 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT16P08779 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT16P08779 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT16P08779 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT16P08779 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT16P08779 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT16P08779 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT16P08779 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT16P08779 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT16P08779 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT16P08779 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT16P08779 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms