Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSLP07711 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSLP07711 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSLP07711 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSLP07711 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSLP07711 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSLP07711 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSLP07711 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSLP07711 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSLP07711 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSLP07711 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSLP07711 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSLP07711 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSLP07711 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSLP07711 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSLP07711 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSLP07711 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSLP07711 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSLP07711 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSLP07711 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSLP07711 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSLP07711 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSLP07711 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSLP07711 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSLP07711 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSLP07711 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSLP07711 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSLP07711 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSLP07711 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSLP07711 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSLP07711 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSLP07711 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSLP07711 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSLP07711 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSLP07711 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSLP07711 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSLP07711 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSLP07711 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSLP07711 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSLP07711 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSLP07711 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSLP07711 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSLP07711 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSLP07711 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms