Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK1P06493 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK1P06493 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK1P06493 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK1P06493 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK1P06493 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK1P06493 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK1P06493 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK1P06493 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK1P06493 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK1P06493 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK1P06493 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK1P06493 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK1P06493 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK1P06493 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK1P06493 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK1P06493 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK1P06493 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK1P06493 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK1P06493 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK1P06493 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK1P06493 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK1P06493 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK1P06493 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK1P06493 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK1P06493 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK1P06493 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK1P06493 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK1P06493 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK1P06493 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK1P06493 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK1P06493 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms