Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNAP02545 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNAP02545 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNAP02545 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNAP02545 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNAP02545 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNAP02545 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNAP02545 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNAP02545 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNAP02545 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNAP02545 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNAP02545 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNAP02545 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNAP02545 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNAP02545 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNAP02545 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNAP02545 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNAP02545 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNAP02545 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNAP02545 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNAP02545 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNAP02545 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNAP02545 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNAP02545 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNAP02545 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNAP02545 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNAP02545 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNAP02545 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNAP02545 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNAP02545 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms