Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSPAN13O95857 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms