Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC2O95347 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC2O95347 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC2O95347 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC2O95347 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC2O95347 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC2O95347 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC2O95347 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC2O95347 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC2O95347 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC2O95347 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC2O95347 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC2O95347 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC2O95347 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC2O95347 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC2O95347 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC2O95347 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC2O95347 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC2O95347 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC2O95347 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC2O95347 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC2O95347 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC2O95347 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC2O95347 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC2O95347 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC2O95347 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC2O95347 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC2O95347 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC2O95347 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC2O95347 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC2O95347 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC2O95347 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC2O95347 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC2O95347 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC2O95347 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC2O95347 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC2O95347 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC2O95347 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms