Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRATO95237 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRATO95237 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRATO95237 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRATO95237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRATO95237 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRATO95237 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRATO95237 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRATO95237 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRATO95237 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRATO95237 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRATO95237 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRATO95237 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRATO95237 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRATO95237 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRATO95237 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRATO95237 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRATO95237 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRATO95237 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRATO95237 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRATO95237 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRATO95237 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRATO95237 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRATO95237 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRATO95237 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRATO95237 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRATO95237 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRATO95237 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRATO95237 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRATO95237 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRATO95237 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms