Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.25■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC49.24■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC49.21■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
ABCC9O60706 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC49.19■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC49.14■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
ABCC9O60706 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC49.12■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC49.1■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC49.08■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.07■■■■■ 5.45
ABCC9O60706 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC49.06■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC49.06■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC49.05■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC49.05■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC49.03■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC49.02■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC49.02■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
ABCC9O60706 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC48.99■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC48.99■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.98■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC48.95■■■■■ 5.43
ABCC9O60706 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC48.91■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.9■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC48.89■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
ABCC9O60706 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms