Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPX2O60687 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPX2O60687 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPX2O60687 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms