Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms