Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPAG9O60271 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SPAG9O60271 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPAG9O60271 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SPAG9O60271 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SPAG9O60271 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms