Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRTM2O43300 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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