Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF113AO15541 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF113AO15541 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF113AO15541 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF113AO15541 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms