Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP3O15049 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
N4BP3O15049 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms