Protein–RNA interactions for Protein: O00625

PIR, Pirin, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIRO00625 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIRO00625 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIRO00625 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIRO00625 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIRO00625 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIRO00625 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIRO00625 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIRO00625 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIRO00625 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIRO00625 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIRO00625 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIRO00625 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIRO00625 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIRO00625 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIRO00625 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIRO00625 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIRO00625 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIRO00625 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIRO00625 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIRO00625 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIRO00625 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIRO00625 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIRO00625 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIRO00625 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIRO00625 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIRO00625 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIRO00625 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIRO00625 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIRO00625 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIRO00625 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIRO00625 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIRO00625 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIRO00625 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIRO00625 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIRO00625 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIRO00625 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIRO00625 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIRO00625 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms