Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC188H7C350 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC188H7C350 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1130 ms