Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms