Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PMD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PMD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PMD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PMD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PMD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PMD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E9PMD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9PMD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9PMD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9PMD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9PMD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9PMD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E9PMD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9PMD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9PMD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9PMD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
E9PMD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9PMD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E9PMD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9PMD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9PMD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9PMD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PMD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9PMD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9PMD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PMD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PMD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PMD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PMD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PMD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PMD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms