Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHLA1C9JL84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HHLA1C9JL84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HHLA1C9JL84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms