Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD1B0YJ81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD1B0YJ81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD1B0YJ81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms