Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRR3A8MPY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRR3A8MPY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms