Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP69A5D8W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP69A5D8W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms