Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP69A5D8W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP69A5D8W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP69A5D8W1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP69A5D8W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms