Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMX2A2RU54 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMX2A2RU54 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms