Protein–RNA interactions for Protein: A0A589

TCRBV7S2A1N4T, V_segment translation product (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV7S2A1N4TA0A589 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms