Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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