Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms